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球囊菌胁迫中华蜜蜂幼虫肠道过程中病原的转录组学研究


澳门威斯人官网平台   发布时间: 2018-10-29   信息员:  


球囊菌胁迫中华蜜蜂幼虫肠道过程中病原的转录组学研究.pdf


作者:郭睿# ,陈大福 #* ,黄枳腱,梁勤,熊翠玲,徐细建,郑燕珍,张曌楠,解彦玲,

      童新宇,侯志贤,江亮亮,刀晨


摘要:【目的】本研究利用 RNA-seq 技术对球囊菌胁迫的中华蜜蜂(中蜂)幼虫肠道进行深度测序,经趋势分析得到差异表达基因(DEGs)的显著表达模式,进而对胁迫过程中的球囊菌进行转录组学分析。【方法】利用 Illumina HiSeq 2500 平台对球囊菌胁迫的中蜂幼虫肠道进行深度测序,并利用相关软件进行了深入分析。最后,通过 RT-qPCR  RNA-seq 数据进行了验证。【结果】本研究共得到球囊菌的 41133932条高质量 clean reads22865  DEGs 共聚类为 8 个基因表达模式,其中,16769  DEGs 聚类为 2 个显著上调趋势与 2 个显著下调趋势。GO 富集分析结果显示,显著上调与显著下调趋势中的 DEGs 分别富集于 40  37  GO term,基因富集数最多的为细胞进程(2486 unigenes)KEGG 代谢通路(pathway)富集分析结果显示,显著上调与显著下调趋势中的 DEGs 分别富集于 119  112  pathway,基因富集数最多的分别是氨基酸生物合成(127 unigenes)与核糖体(98 unigenes)。进一步分析表明球囊菌在胁迫中蜂幼虫肠道的过程中通过提高物质合成促进其增殖,而宿主通过抑制球囊菌的蛋白合成抵御病原入侵。富集在 MAPK 信号通路的 11  DEGs 的表达水平随着胁迫时间的延长而逐渐下降,推测中蜂幼虫通过抑制该通路而阻遏球囊菌增殖。【结论】本研究不仅为揭示白垩病过程中的球囊菌-中蜂幼虫互作提供了重要信息,也为阐明不同抗性蜂种的球囊菌抗性差异奠定了基础。


关键词:球囊菌,中华蜜蜂,幼虫肠道,趋势分析,转录组


发表信息:微生物学报, 2017, 57(12): 1865-1878